Frem til 1990 hadde akvakulturproduksjonen i Chile enda ikke nådd 100.000 tonn, men oppdrettsnæringen blomstret i en slik fart at det gjorde det mulig å nå en årlig produksjon på over 800.000 tonn innen 2007. Men på den tiden ble laksenæringen rammet av ILA (infeksiøs lakseanemi), og produksjonen ble nær halvert.
Krisen førte til en reorganisering av institusjonene som forvalter akvakulturnæringen i Chile. Fiskeridirektoratet er radikalt styrket og en egen minister for akvakultur kan bli en realitet. Kontrollorganet er fiskeridirektoratet, som er kjent som Sernapesca.
